El programa académico de la Maestría en Innovación Educativa pretende formar expertos que sean agentes de cambio, con efectivas habilidades de liderazgo y comunicación, que atiendan a las necesidades que se le presenten en el ámbito de la investigación y la docencia en las instituciones educativas formales de cualquier nivel escolar; también de que den respuesta adecuada a comunidades o grupos con diversas necesidades educativas, lo anterior, encaminado hacia el desarrollo social.

La Maestría en Innovación Educativa pretende contribuir en la generación de nuevos conocimientos que permitan la producción de alternativas de solución que puedan servir para hacer frente a la problemática de la educación superior en la Región, a partir de la formación de agentes que impulsen el desarrollo de las instituciones, por medio de la investigación así como del diseño y la instrumentación de estrategias que les permitan la articulación del quehacer académico con las necesidades de desarrollo de la comunidad en la que se inscriben.